Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rdh11Q9QYF1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rdh11Q9QYF1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms