Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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