Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms