Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms