Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms