Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rabgef1Q9JM13 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rabgef1Q9JM13 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rabgef1Q9JM13 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rabgef1Q9JM13 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
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