Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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