Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Col5a3Q9JLI2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms