Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tgm1Q9JLF6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tgm1Q9JLF6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tgm1Q9JLF6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tgm1Q9JLF6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tgm1Q9JLF6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tgm1Q9JLF6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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