Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms