Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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