Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms