Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms