Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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