Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cldn19Q9ET38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn19Q9ET38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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