Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek6Q9ES70 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek6Q9ES70 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek6Q9ES70 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nek6Q9ES70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms