Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms