Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cse1lQ9ERK4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms