Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr61Q9ERF3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr61Q9ERF3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms