Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms