Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms