Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms