Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms