Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms