Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hmg20aQ9DC33 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmg20aQ9DC33 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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