Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk1dQ9DC28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms