Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Med27Q9DB40 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms