Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Pdzd9Q9D9M4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Pdzd9Q9D9M4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms