Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms