Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jam3Q9D8B7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jam3Q9D8B7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms