Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyp2c55Q9D816 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cyp2c55Q9D816 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms