Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms