Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms