Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx29Q9D3S3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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