Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms