Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms