Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syf2Q9D198 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms