Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd3Q9D176 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms