Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ift27Q9D0P8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Ift27Q9D0P8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ift27Q9D0P8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ift27Q9D0P8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ift27Q9D0P8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ift27Q9D0P8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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