Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc47Q9D024 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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