Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms