Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sgo1Q9CXH7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sgo1Q9CXH7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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