Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkrip1Q9CWV6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms