Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Malsu1Q9CWV0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms