Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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