Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms