Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim8Q9CQQ0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms