Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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