Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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