Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl11Q9CQF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms